Грибы играют важную роль в процессе разложения и минерализации отмирающей древесной массы. Не будь грибов, леса задыхались бы от того количества органических остатков, которые нагромождаются в процессе их жизнедеятельности. От скорости круговорота веществ в лесных экосистемах во многом зависит и производительность, лесов. Грибам в этом отношении принадлежит важная роль. Часть грибов приспособилась к питанию более легкими и доступными органическими веществами, которые содержатся в живых клетках. Именно эти грибы и образуют микоризные связи с высшими растениями. К микоризным относятся наиболее ценные виды съедобных грибов. В то же время они имеют большое значение в снабжении деревьев и кустарников влагой и элементами минерального питания.
Особо важную роль микоризные грибы играют в обеспечении деревьев и кустарников теми элементами питания, которые не имеют газовых форм и вследствие этого постоянно вымываются с почвы. К таковым прежде всего относится фосфор. В почве он может соединяться с катионами кальция, железа, алюминия и образовывать труднодоступные для растений соединения. Поэтому коэффициент усвоения фосфора высшими растениями довольно низкий. В то же время микоризные грибы способствуют лучшему усвоению растениями фосфора из труднодоступных соединений. То же самое можно сказать о калии и некоторых микроэлементах.
Микоризные грибы помогают деревьям переносить почвенную засуху, так как грибница продолжает функционировать при таких уровнях осмотического давления, когда корни деревьев уже не в состоянии. Среди грибов-макромицетов, в том числе и съедобных, имеются паразитические. Опенок настоящий часто тесными группами растет у основания молодых неокрепших елей в лесокультурах, вызывая их гибель. Он ускоряет процесс распада дубрав, ослабленных антропогенными факторами, морозами, насекомы- мифиллофагами и т. д. Имеющее место заболевание корней сосны вызывается корневой губкой — РотКорздзаппоэа. Заболевание наблюдается в сосновых культурах на старопахотных землях. Корневой губкой могут поражаться также пихтовые и еловые леса. Правильным подбором культивируемых пород и соответствующей агротехникой можно противостоять данному заболеванию.