Заболевание встречается практически во всех регионах возделывания кукурузы. В отличие от пыльной головни, пузырчатая головня проявляется в виде патологических новообразований (галлов) на всех частях растений, но наиболее часто на листьях и початках. При поражении листьев наблюдается образование вздутий в виде группы шероховатых морщин. В метелках поражаются отдельные цветки с образованием мешковидных вздутий обычно небольших размеров. На стеблях и початках формируются крупные галлы, в которых формируются телиоспоры гриба. Созревшие в галлах споры способны прорастать и заражать растения в течение всего вегетационного периода. Осенью при уборке кукурузы головневые вздутия отламываются и могут зимовать на кукурузном поле. Весной, перезимовавшие споры вновь заражают кукурузу. Наиболее высокая восприимчивость кукурузы к болезни наблюдается в период от выбрасывания метелок до молочной спелости.
Развитию пузырчатой головни способствует засушливая погода, небольшие осадки во время заражения, а также загущенный посев. Наиболее вредоносно заболевание при поражении початков и стеблей кукурузы. Снижение урожая может достигать 25–30%, а в условиях засухи — 50%. Кукуруза, пораженная пузырчатой головней, более подвержена поражению стеблевой гнилью. Болезнь, развивающаяся на молодых растениях, может убить их.
Защитные мероприятия должны быть направлены на удаление с полей послеуборочных остатков кукурузы, отбор здоровых семенных початков. Протравливание семян решает проблему лишь семенной инфекции, т.к. заражение возможно и в более поздние фазы. Наиболее эффективным средством контроля заболевания является подбор устойчивых или толерантных гибридов и их пространственная изоляция.