Пикировка (пересадка) сеянцев необходима для того, чтобы растение получило достаточный объем почвы и воздуха для дальнейшего роста и развития. Чем раньше проводят пикировку (в фазу развернутых семядолей), тем лучше растения ее переносят. Но из-за того, что они очень маленькие и неокрепшие, большая часть их при этом повреждается. Оптимальный срок пикировки — появление 1-2-го настоящего листа. Это бывает через 10-14 дней после всходов.
При пикировке в холодные парники или временные пленочные укрытия берут сеянцы, у которых есть 2-3 настоящих листа. Для пикировки отбирают здоровые, хорошо развитые растения. Накануне почву в ящике хорошо увлажняют. Сеянцы небольшой щепкой или просто пальцем осторожно подкапывают, стараясь как можно меньше повредить корневую систему.
Пикируют их в торфоперегнойные, бумажные, картонные, полиэтиленовые или другие горшочки диаметром 8-12 см. Почвенная смесь, которой заполняют горшочек, состоит из 7 объемных частей низинного разложившегося торфа, 2 частей перегноя и 1 части дерновой земли. Можно приготовить почвенную смесь и из 3 частей опилок, 1 части земли, 2 частей торфа. Полученную смесь поливают раствором минеральных удобрений из расчета, г на 10 л воды: аммиачной селитры — 10, суперфосфата — 50, сернокислого калия — 20, сульфата магния — 10.
При ранних сроках посева желательно пикировать растения в теплые парники, при более поздних — в холодные парники или неотапливаемые простейшие пленочные укрытия. В большинстве же случаев любители выращивают рассаду дома, на подоконнике.
Если почва не прогрелась до температуры выше 15 °С, пикировку проводить не следует: корневая система томата в таких условиях практически не функционирует.
Перед пикировкой почвенную смесь хорошо увлажняют. Горшочки ставят плотно один к другому. На 1 м2 можно разместить 80-100 растений. В почве делают ямку глубиной 5-6 см, в которую по семядоли опускают сеянец. Необходимо следить за тем, чтобы его корешок не загибался вверх. Почву вокруг подсемядольного колена пальцами слегка уплотняют, чтобы корни растения имели с ней хороший контакт.
Пересаженные сеянцы поливают теплой водой и притеняют на 1-2 дня, что способствует быстрому укоренению. При выращивании в горшочках корневая система растений хорошо развивается и не повреждается при пересадке. Пикировать сеянцы можно и непосредственно в грунт парника или теплицы. Однако такая рассада при пересадке в открытый грунт теряет 50-60% корней. Это приводит к ее плохому укоренению и отставанию в росте и развитии. Чтобы как-то сохранить корневую систему и улучшить приживаемость такой рассады, за 5—7 дней до ее посадки ножом прорезают в двух взаимно перпендикулярных направлениях парниковую почву на глубину 8-10 см. В местах прорезов образуются многочисленные новые корни, которые и позволяют высадить растение с комом земли.