
Деревья гинкго разделяются на женские и мужские экземпляры. У женских растений цветки собраны в небольшие зеленовато-желтые соцветия.
Вплоть до начала цветения молодых гинкго невозможно точно определить, какое это растение - женское или мужское. Лишь делается предположение в зависимости от характера формирования кроны: у мужских экземпляров она обычно пирамидальная и более стройная, а у женских более широкая и округлая.
Деревца гинкго билоба начинают цвести, давать пыльцу и семена в возрасте 25-30 лет. Ни одно дерево на Земле больше не размножается подобным образом. Способ размножения гинкго сближает его с папоротниками и другими споровыми растениями, у которых оплодотворение осуществляется с помощью плавающих мужских половых клеток. У всех остальных деревьев мужские половые клетки самостоятельно передвигаться не могут.
Семя гинкго покрыто мясистым покрывалом (подобно сливе) жгуче-вяжущего вкуса, с неприятным запахом.